یکی از مشکلات اساسی باشگاه استقلال که تقریباً به یک عادت تبدیل شده، بدهی‌های داخلی و خارجی است، اتفاقی که در پرسپولیس هم دیده می‌شود. دلیل عمده این بدهی‌ها، نداشتن بودجه مشخص، هزینه‌های زیاد، بدهی‌های گذشته و سوءمدیریت بوده است.
در فصل جاری، مدیریت استقلال بودجه خود را مشخص کرد و از کارگزارش مبلغ قابل توجهی گرفت، اما بیشتر آن صرف بدهی‌های داخلی و خارجی شد، به همین دلیل است که بازیکنان از دریافتی‌ها رضایت ندارند و هزینه‌های زیادی نیز روی دست باشگاه باقی مانده است.
در این میان، باشگاه استقلال منتظر رأی پرونده آندره‌آ استراماچونی سرمربی ایتالیایی سابق خود است، پرونده‌ای که استقلال برای اعتراض به آن به دادگاه ورزشی CAS هزینه کرده است. بر کسی پوشیده نیست که خود مدیران استقلال هم می‌دانند در این پرونده شانس خیلی زیادی ندارند و باید مطالبات استراماچونی را پرداخت کنند، مطالباتی که گفته می‌شود یک میلیون و 380 هزار یورو به همراه پنج درصد بابت تأخیر در پرداخت است.
اما بد نیست بدانید مدیریت فعلی استقلال از طریق واحد حقوقی خود به دنبال گرفتن طلب‌های باشگاه از برخی از اسپانسرها و کارگزاران سال‌های قبل است. این باشگاه مدعی داشتن طلب بالای 50 میلیاردی از یک اسپانسر است که با وجود تبلیغات صورت گرفته حق و حقوق باشگاه استقلال را پرداخت نکرده است. یکی دو کارگزار دیگر نیز مبالغی را طبق ادعای باشگاه باید پرداخت می‌کردند که این اتفاق نیفتاده است. روز گذشته بود که مسئول حقوقی باشگاه استقلال اعلام کرد اگر بتوانند این مبالغ را بگیرند، طلب استراماچونی به همراه بخش زیادی از بدهی‌های داخلی پرداخت خواهد شد.
