به گزارش صراط، مهرگان
در سال‌های گذشته دو بار سابقه بازداشت را داشت که هر دو بار با قرار
وثیقه از زندان آزاد شد. اولین بازداشت وی به دستگیری‌های پس از عاشورای
سال 88 باز می‌گردد. وی در آن دوره دبیر ضمیمه سیاسی روزنامه اعتماد بود و
حدود دو ماه را در بازداشت بسر برد.همان زمان برخی رسانه‌ها از ارتباطات او با تشکل غیر قانونی نهضت آزادی و همچنین برخی گروه‌های متمایل به جریان‌های جدایی‌طلب خبر دادند.
علی افشاری از عناصر ضد انقلاب نیز حدود یک ماه پس از بازداشت کیوان مهرگان در یادداشتی مدعی شد که بازداشت مهرگان بدلیل تحت فشار گذاشتن نهضت آزادی برای تعطیلی فعالیت‌های این تشکل بوده است!
مهرگان پس از آزادی از بازداشت اول به سه سال حبس تعلیقی محکوم شد اما در روز 16 آذر 89 برای دومین بار بازداشت شد. بازداشت وی در جریان دستگیری تعدادی از خبرنگاران روزنامه شرق در محل این روزنامه رخ داد. او در این مقطع دبیری سرویس سیاسی روزنامه شرق را برعهده داشت و یکی از سایت‌های خبری در خصوص بازداشتی‌های روزنامه شرق و کیوان مهرگان نوشت: "روزنامه شرق در دور جديد فعاليت خود نيز به رويكرد سياه‌نمايانه و القاي شبهات و ناكارآمد نشان دادن نظام در حل مسائل داخلي و خارجي ادامه داده است".
این وب سایت در ادامه افزود که کیوان مهرگان "پس از بي‌توجهي به اخطارهاي مسئولان درباره خودداري از تفرقه افكني و تحريك مردم به شورش و التهاب آفريني و ايفاي نقش مهم در رهبري رسانه اي جريان فتنه و تحريك دانشجويان و جوانان به اغتشاش و بي حرمتي نسبت به مقدسات بازداشت شد.وي به عنوان ليدر بخش عمده اي از جريان اطلاع رساني تحريف شده و هدف دار در جهت تحريك اقشار مختلف بخصوص جوانان و به خيابان كشيدن آنان نقش مؤثري داشت".
مهرگان پس از بازداشت دوم نهایتا در اسفند ماه سال 90 با "اتهام تبلیغ علیه نظام" به یک سال حبس تعزیری و ۵ سال محرومیت از فعالیت های مطبوعاتی، سیاسی، فرهنگی و مجازی محکوم شد؛ اگرچه به زندان نرفت.
نام کیوان مهرگان در جریان فتنه سال 88 در ذیل بسیاری از اطلاعیه‌ها و بیانیه‌ها در حمایت از جریان ساختارشکن به چشم می‌خورد. وی با اغلب نشریات و روزنامه‌های متمایل به جریان فتنه نیز همکاری داشته است.
ظرف دو روز گذشته نیز 12تن از عناصر رسانه‌ای مرتبط با محافل جریان فتنه بازداشت شده بودند. جواد دلیری، نسرین تخیری، ساسان آقایی (از روزنامه اعتماد) میلاد فدایی اصل (دبیر سیاسی ایلنا)، سلیمان محمودی، پژمان موسوی، امیلی امرایی (از روزنامه بهار)، مطهره شفیعی و نرگس جودکی (از روزنامه آرمان)، پوریا عالمی (از روزنامه شرق)، اکبر منتجبی (سردبیر هفته نامه آسمان) و صبا آذرپیک ترکیب بازداشت شدگان را تشکیل می‌دهند.
