همکاری منافقین بعضا به جایی می رسید که ساواک از ایشان در قالب همکار استفاده می کرد اما نهایتا اعضای نگون بخت سازمان که تصور می کردند از مجازات رها خواهند شد اغلب اعدام شدند.
وحید افراخته یکی از اعضای اصلی منافقین بود که همکاری وی با ساواک منجر به لو رفتن تعداد زیادی از افراد و خانه تیمی ها شد،خانم مرضیه دباغ در خصوص وی نقل می کنند که روزی وی را در کمیته مشترک دیدم که با بازجوی ساواک می خندید و سیگار می کشید، به او گفتم "وحید تو آمریکایی کشتی اینها به تو رحم نمی کنند" و او بی توجهی کرد.
در نهایت نیز وحید افراخته در سال 54 به همراه تعداد دیگری از اعضای سازمان توسط ساواک اعدام شدند.
یکی از اعضای اداره هشتم ساواک نیز در گفتگو با دیده‌بان عنوان کرد که در سال های دهه 50 تیم‌های ما مسعود رجوی را با چادر زنانه به خیابان می بردند و وی از نزدیک اعضای سازمان و خانه های تیمی را لو می داد و همکاری بی چون و چرای وی با ساواک موجب شد که بهانه ای برای رهایی از اعدام و گرفت حکم حبس ابد برای وی اتخاد شود.
نکته جالب توجهی که در مسئله همکاری اعضای سازمان و ساواک مشهود است ظاهر سازی ساواک برای گرفتن تخفیف در مجازات و در عین حال نظارت مستقیم شاه برای اعدام افرادی همچون افراخته بوده است.
در سندی که در پی می آید درخواستی برای تجدید نظر از حکم های تعیین شده برای عناصر منافقین از شاه دیده می شود که نهایتا شاه دستور به اعدام و اجرای احکام اعضای سازمان می دهد.
سند شماره یک
سند شماره دو
